Der Coach hatte die Nordiren zur EM 2016 in Frankreich und damit erstmals überhaupt zu einem Großereignis geführt. Der 48-Jährige soll pro Jahr etwa 790.000 Euro kassieren.
"Ich bin sehr stolz darauf, mein Land als Teammanager zu führen und fühle mich geehrt, meine Arbeit mit der Nationalmannschaft fortsetzen zu dürfen", sagte O'Neill, der nun auch die Rolle des Chief Football Officer übernehmen wird und damit verantwortlich für die Entwicklung des Fußballs in Nordirland ist.
Zuletzt hatte unter anderem der schottische Verband sein Interesse an O'Neill bekundet. Der Coach hatte das Werben aus Schottland als "große Ehre" bezeichnet.
Bei der WM in Russland in diesem Sommer fehlen die Nordiren. In den Play-offs scheiterten sie an der Schweiz.