Regensburg hatte am Samstag in Chemnitz 1:4 verloren und bereits fünf Punkte Rückstand auf einen Nichtabstiegsplatz.
Die Vereinsführung wolle mit dieser Maßnahme "angesichts der schwierigen sportlichen Situation einen neuen Impuls setzen, um das elementare Ziel Klassenerhalt weiterhin energisch zu verfolgen", hieß es in einer Pressemitteilung.
Noch vor dem Heimspiel gegen Bielefeld am 22. November soll ein Nachfolger von Schmidt präsentiert werden. Schmidt hatte den Jahn erst vor der Saison übernommen, in 17 Spielen aber nur drei Siege erreicht. Dagegen standen elf Niederlagen.
Schon bei Zweitligist 1860 München war der 46 Jährige zuvor suspendiert worden.
Die Tabelle der 3. Liga