Der 19 Jahre alte Offensivspieler hatte im Training am Samstag eine Fissur an der rechten Hand erlitten und musste am Sonntag abreisen.
Eine Nachnominierung ist nach Angaben des Deutschen Fußball-Bundes (DFB) nicht vorgesehen.
Die U21-Auswahl reist am Sonntagvormittag von Hamburg zum Spiel nach Baku.
Die deutsche U21-Nationalmannschaft in der Übersicht