Der 23-Jährige war nach einem Faserriss erst vor knapp zwei Wochen im Heimspiel gegen den 1. FSV Mainz 05 in den Kader zurückgekehrt.
Boey war als teuerster Wintertransfer der Liga für 30 Millionen Euro plus Boni von Galatasaray gekommen. Bislang absolvierte der Franzose in der Bundesliga zwei Spiele für die Bayern.
Flügelstürmer Kingsley Coman und Rechtsverteidiger Noussair Mazraoui machen dagegen weitere Schritte auf dem Weg zum angestrebten Comeback. Nach Angaben der Münchner nimmt das Duo wieder am Teamtraining teil.
